GRE tunel v MK nepodporuje fragmentaci (vynechme kombinaci MPLS over GRE, což funguje, pak fragmentovat umí), takže pokud GRE nastavíš MTU v tunelu na 1500, tak ti trasa mezi konci GRE tunelu v celé trase musí přenést 1524 (20 bajtů IP hlavička, 4 bajty základní GRE hlavička), což u většiny Mikrotiků a jeho bezdrátů by mohla být pravda (jen řada RB4xx má limit na 1520 nebo 1522). EoIP netuneluje L3, ale L2, takže aby propustil MTU1500 pro IP, tak potřebuje 1542 MTU v síti (20 bajtů IP hlavička, 8 bajtů GRE rozšířená hlavička, 14 bajtů už tunelované Ethernet záhlaví), což už nemusí projít, takže pak musí fragmentovat, což zdržuje, protože pro dlouhé pakety ti to v podstatě vyvolá dvojnásobný paket/sec tok.